Los investigadores del área de Computación de Altas Prestaciones del CITIC, Christian Ponte, Jorge González y María José Martín, junto con el investigador del Centro de Investigación Mariña de la Universidad de Vigo, Antonio Carvajal, han publicado un artículo en la revista BMC Bioinformatics que lleva por título “Toxo: a library for calculating penetrance tables of high-order epistasis models”.

Toxo es una biblioteca de MATLAB diseñada para calcular tablas de penetración de modelos de epistasis de cualquier orden de interacción que se parezcan más a datos reales. El usuario especifica la heredabilidad (o prevalencia) deseada y el programa maximiza la prevalencia (o heredabilidad) de la tabla de acuerdo con los límites del modelo epistático de entrada.

De esta forma, Toxo extiende las capacidades de los simuladores existentes que definen la epistasis utilizando tablas de penetrancia. Estas tablas se pueden usar directamente como entrada para simuladores de software como GAMETES para que puedan generar muestras de datos con interacciones más grandes y prevalencias y herencias más realistas.

El artículo completo se puede consultar en BMC Informatics: Toxo: a library for calculating penetrance tables of high-order epistasis models