Os investigadores da área de Computación de Altas Prestacións do CITIC, Christian Ponte, Jorge González e María José Martín, xunto co investigador do Centro de Investigación Mariña da Universidade de Vigo, Antonio Carvajal, publicaron un artigo na revista BMC Bioinformatics que leva por título “Toxo: a library for calculating penetrance tables of high-order epistasis models”.

Toxo é unha biblioteca de MATLAB deseñada para calcular táboas de penetración de modelos de epistasis de calquera orde de interacción que se parezan máis a datos reais. O usuario especifica a heredabilidade (ou prevalencia) desexada e o programa maximiza a prevalencia (ou heredabilidade) da táboa de acordo cos límites do modelo epistático de entrada.

Desta forma, Toxo estende as capacidades dos simuladores existentes que definen a epistasis utilizando táboas de penetrancia. Estas táboas pódense usar directamente como entrada para simuladores de software como GAMETES para que poidan xerar mostras de datos con interaccións máis grandes e prevalencias e herdanzas máis realistas.

O artigo completo pódese consultar en BMC Informatics: Toxo: a library for calculating penetrance tables of high-order epistasis models