Un grupo de investigadores da área de Ciencia e Enxeñaría de Datos do CITIC, dirixido por Susana Ladra e José Paramá, atópase desenvolvendo un proxecto de investigación para a caracterización de cuasiespecies virais do SARS-CoV-2, a investigación é unha parte central da tesis doutoral do investigador Borja Freire.

As cuasiespecies son as diferentes cepas que se atopan nunha persoa infectada, unha mestura heteroxénea de xenomas moi relacionados entre si, cunha similitude superior ao 98 %. Así, co obxectivo de entender o virus e os seus mutacións, contribuíndo ao seu caracterización, esta iniciativa estuda o xenoma do virus, comparando diferentes xenomas obtidos de diferentes mostras para ver onde muta o virus e onde non muta nunca, é dicir, que é o que é esencial para o virus e que non cambia. Isto permitirá atopar tratamentos e vacinas contra o virus.

Desde o CITIC, no marco dun proxecto europeo que liderou o centro, e en colaboración coa Universidade de Helsinki, desenvolveuse un software que aborda o problema de ensamblaxe de cuasiespecies virais, que permite caracterizar as cuasiespecies presentes nunha mostra a partir de datos de secuenciación. Os resultados experimentais mostran que este software é preciso e rápido, algo que non se consegue simultaneamente por outros métodos existentes actualmente. Ademais, permite recuperar cuasiespecies de baixa abundancia, que a miúdo se pasan por alto outras técnicas.